RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 ILVBLA1L0T0 632 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 E7ENX8 843 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 ACOT8O14734 319 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 SRP72O76094 671 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 CDK14O94921 469 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 PRLP01236 227 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 LRP8Q14114 963 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 GEN1Q17RS7 908 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 UGT3A2Q3SY77 523 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 PAQR3Q6TCH7 311 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 PHC3Q8NDX5 983 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 OR9I1Q8NGQ6 314 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 LPGAT1Q92604 370 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 ZBED2Q9BTP6 218 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 CCDC68Q9H2F9 335 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa19.19■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 SUPT3HB4E1H0 165 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 MAP3K13O43283 966 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 SUPT3HO75486 399 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 NDUFS3O75489 264 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 SEC24AO95486 1093 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 RNF220Q5VTB9 566 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 LRRC43Q8N309 656 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 ICA1LQ8NDH6 482 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 OVCA2Q8WZ82 227 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 SCLYQ96I15 445 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 LRGUKQ96M69 825 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 TAS2R13Q9NYV9 303 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa19.18■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 CAPN8A6NHC0 703 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 C2orf81A6NN90 581 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 VCLP18206 1134 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 MED21Q13503 144 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 ADGRE1Q14246 886 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 USP41Q3LFD5 358 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 KLHDC10Q6PID8 442 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 SPATA24Q86W54 205 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 DLG3Q92796 817 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 WBP2Q969T9 261 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 KLHL32Q96NJ5 620 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 ASB2Q96Q27 587 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 MUC3BQ9H195 1237 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 AKTIPQ9H8T0 292 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 SYTL2Q9HCH5 934 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 PDP2Q9P2J9 529 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 IKZF3Q9UKT9 509 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 RNF112Q9ULX5 631 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 MED16Q9Y2X0 877 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 RAI2Q9Y5P3 530 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 A0A1B0GVM2 712 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 TXNDC9O14530 226 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 MRASO14807 208 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 KERAO60938 352 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 FOXA1P55317 472 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 STX1BP61266 288 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 PAOXQ6QHF9 649 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 TRPC4APQ8TEL6 797 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 KIAA1191Q96A73 305 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 DCUN1D1Q96GG9 259 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 SLC25A23Q9BV35 468 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 VN1R3Q9BXE9 311 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 DERL2Q9GZP9 239 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 UNC93B1Q9H1C4 597 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa19.17■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 AZIN1O14977 448 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 F11P03951 625 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 ATP4BP51164 291 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 RAD51Q06609 339 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 CHST9Q7L1S5 443 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 EFHBQ8N7U6 833 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 TWIST2Q8WVJ9 160 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 CEP295NLQ96MC4 621 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 GCNAQ96QF7 691 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 KCNA7Q96RP8 456 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 GPR21Q99679 349 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 GIMAP2Q9UG22 337 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 RIMS3Q9UJD0 308 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 SARDHQ9UL12 918 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 PIP5K1BO14986 540 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 LPOP22079 712 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 RALGDSQ12967 914 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 PLD1Q13393 1074 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 TSNQ15631 228 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 PTPRNQ16849 979 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 KIF19Q2TAC6 998 aa19.16■□□□□ 0.66
USP21-201ENST00000289865 FBXO48Q5FWF7 155 aa19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms