RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 ENTPD1P49961 510 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 YBX1P67809 324 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF549Q6P9A3 640 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZNX1 250 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RHEBL1Q8TAI7 183 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TADA1Q96BN2 335 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 POPDC3Q9HBV1 291 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 DSEQ9UL01 958 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ACVR1Q04771 509 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM125Q96AQ2 219 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 C1orf74Q96LT6 269 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TCRBV5S2A0A599 114 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 LDB2O43679 373 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP11A1P05108 521 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PGFP49763 221 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SCNN1BP51168 640 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TLK2Q86UE8 772 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CXorf21Q9HAI6 301 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 POLG2Q9UHN1 485 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CDC14AQ9UNH5 594 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 OR51F1A6NGY5 319 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ARL5CA6NH57 179 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CCL22O00626 93 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS4BO75351 444 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 IDO1P14902 403 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 DCKP27707 260 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MAXP61244 160 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TNK2Q07912 1038 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SCD5Q86SK9 330 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RRAGCQ9HB90 399 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 FAIMQ9NVQ4 179 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CRYL1Q9Y2S2 319 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CLOCKO15516 846 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TPST1O60507 370 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 HGFP14210 728 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 CHRM3P20309 590 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 RFC2P35250 354 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 DSC2Q02487 901 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4D1Q15615 310 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 MARC1Q5VT66 337 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 METTL23Q86XA0 190 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR150Q8NGU9 434 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ATOH8Q96SQ7 321 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR45Q9Y5Y3 372 aa22.08■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM64BA6NI03 449 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEB3O15480 346 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC2A3P11169 496 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 IMPDH2P12268 514 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXC8P31273 242 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 CAPGP40121 348 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ITKQ08881 620 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 OGFOD2Q6N063 350 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF554Q86TJ5 538 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 DDIASQ8IXT1 998 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TEX26Q8N6G2 289 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 LPPQ93052 612 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 EXT2Q93063 718 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 FADS3Q9Y5Q0 445 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1W2PP18 115 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 J3KR12 359 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 UBXN8O00124 270 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 SNAP91O60641 907 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 UMPSP11172 480 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 SCNN1GP51170 649 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIK2Q13002 908 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TERB1Q8NA31 727 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXL20Q96IG2 436 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms