RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Jph2Q9ET78 696 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PollQ9QXE2 573 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm29797A0A140LIA7 188 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp985A2A7A5 519 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cd151O35566 253 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Flt3lgP49772 232 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pfkfb2P70265 519 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fam171bQ14CH0 825 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 N4bp2l1Q3V2Q8 238 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cpa2Q504N0 417 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Clec16aQ80U30 1036 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Creg2Q8BGC9 288 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 SntnQ8C9X1 147 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TmieQ8K467 153 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Chrna3Q8R4G9 499 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pcdhga9Q91XX9 932 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Usp11Q99K46 921 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mtfr1Q99MB2 328 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Exoc2Q9D4H1 924 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ttll8A4Q9F1 832 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Skint1A7TZE6 364 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Muc3E9PWP7 378 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r176G3UW31 304 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cyp4f40G3UW81 524 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tuba1bP05213 451 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nat3P50296 290 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AdslP54822 484 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tuba1aP68369 451 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Q3UE31 404 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pak6Q3ULB5 682 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Apobec4Q497M3 374 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Adad1Q5SUE7 619 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ints2Q80UK8 1198 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lrrc8aQ80WG5 810 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Camta2Q80Y50 1208 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Smyd4Q8BTK5 799 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fam53cQ8BXQ8 393 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tbx22Q8K402 517 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tubgcp2Q921G8 905 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Haus8Q99L00 373 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 StambpQ9CQ26 424 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rab11fip1Q9D620 645 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cep295Q8BQ48 2412 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp788E9Q980 884 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Matn2O08746 956 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Birc5O70201 140 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Wfs1P56695 890 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Yipf3Q3UDR8 347 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Psg29Q3URN6 468 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ostf1Q62422 215 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mex3bQ69Z36 601 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mfn1Q811U4 741 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lin7aQ8JZS0 233 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PolbQ8K409 335 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pcdha12Q91Y18 950 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dhrs7Q9CXR1 338 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Scrn1Q9CZC8 414 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cmpk1Q9DBP5 196 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Clic4Q9QYB1 253 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dnajb12Q9QYI4 376 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Myh8P13542 1937 aa7.16□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r14E9Q759 848 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Eef2kO08796 724 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Socs5O54928 536 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tlx1P43345 332 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ffar3Q3UFD7 319 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pabpn1lQ5XFR0 273 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfyve1Q810J8 777 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ccdc50Q810U5 305 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Prr33Q8C494 260 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Acat2Q8CAY6 397 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rsad2Q8CBB9 362 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hacd3Q8K2C9 362 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr385Q8VGT1 312 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pink1Q99MQ3 580 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MtrexQ9CZU3 1040 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Asb5Q9D1A4 329 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Scgb2b20Q9JI02 112 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AuhQ9JLZ3 314 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gpc1Q9QZF2 557 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dyrk1bQ9Z188 629 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Alg6Q3TAE8 507 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AcdQ5EE38 416 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gpr19Q61121 415 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rexo4Q6PAQ4 432 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tmem121Q80XA0 318 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Arhgap28Q8BN58 729 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kiaa1671Q8BRV5 308 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tlk1Q8C0V0 766 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Snx30Q8CE50 437 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 B4galt7Q8R087 327 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Adhfe1Q8R0N6 465 aa7.15□□□□□ -1.26
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vstm5Q9D806 199 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.2 ms