RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SULT2A1Q06520 285 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 INSCQ1MX18 579 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CNTD1Q8N815 330 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 FRMD1Q8N878 549 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SIPA1Q96FS4 1042 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 FEM1AQ9BSK4 669 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ZFATQ9P243 1243 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 VPS28Q9UK41 221 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 MATN3O15232 486 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 GLRA3O75311 464 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 BPGMP07738 259 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 RHOCP08134 193 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ITGA2BP08514 1039 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 NEFHP12036 1026 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SPEM2Q0P670 501 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 DNAAF3Q8N9W5 541 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ARMC2Q8NEN0 867 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 FATE1Q969F0 183 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 KLHL29Q96CT2 875 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ERP27Q96DN0 273 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 LOXL4Q96JB6 756 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 FCRL5Q96RD9 977 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SOX13Q9UN79 622 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 MAFKO60675 156 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 BCKDHBP21953 392 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 MAGEA12P43365 314 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 PLK1P53350 603 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CDH17Q12864 832 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 RIPK1Q13546 671 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 MAP7D1Q3KQU3 841 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ARMC3Q5W041 872 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 LPCAT2Q7L5N7 544 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CACUL1Q86Y37 369 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 PARP9Q8IXQ6 854 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 OR2T3Q8NH03 318 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SAR1AQ9NR31 198 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa21.59■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 DNAJC6O75061 913 aa21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ANXA9O76027 345 aa21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SLC36A4Q6YBV0 504 aa21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 KDM1BQ8NB78 822 aa21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 PRSS16Q9NQE7 514 aa21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 DONSONQ9NYP3 566 aa21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SLC25A13Q9UJS0 675 aa21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 PSAT1Q9Y617 370 aa21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 LAMA1P25391 3075 aa21.58■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 NUP205Q92621 2012 aa21.58■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 USP12O75317 370 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 SPRP35270 261 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 COPAP53621 1224 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 CREB5Q02930 508 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 OLIG2Q13516 323 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 ACCSLQ4AC99 568 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 NUDCD3Q8IVD9 361 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 TMEFF1Q8IYR6 380 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 MRGPRX3Q96LB0 322 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 RBBP8Q99708 897 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 KIFC1Q9BW19 673 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 SLC39A8Q9C0K1 460 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 MTG2Q9H4K7 406 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 KCNK13Q9HB14 408 aa21.57■■□□□ 1.04
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