RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 RIMKLBQ9ULI2 386 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 EPOP01588 193 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINB5P36952 375 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 TUBB3Q13509 450 aa25.5■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf42Q9NWW7 574 aa25.5■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf78A6NCI8 922 aa25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 ITM2AO43736 263 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 AHSGP02765 367 aa25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 RAB10P61026 200 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGA9Q13797 1035 aa25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 C10orf120Q5SQS8 335 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXL22Q6P050 247 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHDC10Q6PID8 442 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA2013Q8IYS2 634 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 STYXQ8WUJ0 223 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC39A10Q9ULF5 831 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 ARSAP15289 507 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 ARNTP27540 789 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 POU6F1Q14863 301 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 TMCO4Q5TGY1 634 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 LIPMQ5VYY2 423 aa25.48■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 USP4Q13107 963 aa25.48■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 PEX11AO75192 247 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 VTI1BQ9UEU0 232 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO5Q9UKT4 447 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 RAP2CQ9Y3L5 183 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 TARM1B6A8C7 271 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 F8W8V4 182 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A2O15244 555 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAMEF11O60813 436 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPA4LO95757 839 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 KITP10721 976 aa25.46■■□□□ 1.67
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