RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	GDF3	Q9NR23	364 aa		24.91	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		24.91	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	HACD3	Q9P035	362 aa		24.91	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	24.91	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC188	H7C350	402 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	TGM1	P22735	817 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	INPP5A	Q14642	412 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	AGER	Q15109	404 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	ALS2CL	Q60I27	953 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	RANBP10	Q6VN20	620 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00523	Q86TU6	105 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	IQCH	Q86VS3	1027 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	AP2M1	Q96CW1	435 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	BMF	Q96LC9	184 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		24.9	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	FRYL	O94915	3013 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	AURKA	O14965	403 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	CER1	O95813	267 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	BNC1	Q01954	994 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	OVGP1	Q12889	678 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	MTM1	Q13496	603 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	SEPT6	Q14141	434 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	CDKN3	Q16667	212 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	ABCG8	Q9H221	673 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	TRABD	Q9H4I3	376 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	GAREM1	Q9H706	876 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	OR1A2	Q9Y585	309 aa		24.89	■■□□□ 1.58
GPS1-223	ENST00000584229	FAM186A	A6NE01	2351 aa		24.89	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	GDF9	O60383	454 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	TUBB4A	P04350	444 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	TPH1	P17752	444 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	GPR1	P46091	355 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	SPINT3	P49223	89 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	NXPH1	P58417	271 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	C2orf54	Q08AI8	447 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	SCAMP4	Q969E2	229 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	LRP4	O75096	1905 aa		24.88	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229		K7ESM1	405 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	TSHR	P16473	764 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	CTSK	P43235	329 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	DR1	Q01658	176 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	CDH17	Q12864	832 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	HLA-B	Q31612	363 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	PNCK	Q6P2M8	343 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	KRT12	Q99456	494 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	APOO	Q9BUR5	198 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	WDR26	Q9H7D7	661 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	PKP3	Q9Y446	797 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	ARL5A	Q9Y689	179 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	C2orf81	A6NN90	581 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	PFN3	P60673	137 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	IL9R	Q01113	521 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	PTK2B	Q14289	1009 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	POU6F1	Q14863	301 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	PELI3	Q8N2H9	469 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	EID2B	Q96D98	161 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	IL21R	Q9HBE5	538 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	RAD18	Q9NS91	495 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	CDC23	Q9UJX2	597 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	24.86	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	24.85	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	CRTAM	O95727	393 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	HTR1B	P28222	390 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GPS1-223	ENST00000584229	GRIA1	P42261	906 aa		24.85	■■□□□ 1.57

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