RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	USP45	Q70EL2	814 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DAW1	Q8N136	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772		E7EWF7	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CLDN5	O00501	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PEX12	O00623	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TMCC2	O75069	709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PIGR	P01833	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CYP21A2	P08686	494 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	EPX	P11678	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ABO	P16442	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF18	P17022	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SDS	P20132	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MX1	P20591	662 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FPR1	P21462	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	POLD2	P49005	469 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PEX6	Q13608	980 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SSPN	Q14714	243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NCF4	Q15080	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ETFDH	Q16134	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772		Q6ZVU0	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SHISA5	Q8N114	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PATE1	Q8WXA2	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MR1	Q95460	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KCNK17	Q96T54	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MED29	Q9NX70	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LCE6A	A0A183	80 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RNF103	O00237	685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772		O00370	1275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SYT5	O00445	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TBL1X	O60907	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	STATH	P02808	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HMBS	P08397	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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