RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576502.5

NDE1-211, Transcript of nudE neurodevelopment protein 1, human

TSL 2

Gene NDE1, Length 1,131 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDE1-211	ENST00000576502	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	LRP4	O75096	1905 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	HACD1	B0YJ81	288 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	YY2	O15391	372 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	OPA1	O60313	960 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	GCAT	O75600	419 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	MT-CO3	P00414	261 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CTNNA2	P26232	953 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CDK3	Q00526	305 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	KIF5A	Q12840	1032 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	ZBTB17	Q13105	803 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CDKN3	Q16667	212 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	NPNT	Q6UXI9	565 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502		Q6ZVL8	140 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	AGAP3	Q96P47	875 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TEX101	Q9BY14	249 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CDH19	Q9H159	772 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	MYLK	Q15746	1914 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	PRSS38	A1L453	326 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	PJA2	O43164	708 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	ZW10	O43264	779 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TCEA3	O75764	348 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	GM2A	P17900	193 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	STC1	P52823	247 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	RWDD2B	P57060	319 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	GSDMD	P57764	484 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	SKOR1	P84550	965 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	XRCC4	Q13426	336 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	PROSER1	Q86XN7	944 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	HAUS1	Q96CS2	278 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CLPB	Q9H078	707 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	USP24	Q9UPU5	2620 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	APOC2	P02655	101 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	PTPN3	P26045	913 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	PTS	Q03393	145 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CDK18	Q07002	472 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	QPCT	Q16769	361 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	GUSBP11	Q6P575	273 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	BBS12	Q6ZW61	710 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	SPC24	Q8NBT2	197 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	HIC2	Q96JB3	615 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TEKT5	Q96M29	485 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	ABCG8	Q9H221	673 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	AMFR	Q9UKV5	643 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	RP1	P56715	2156 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NDE1-211	ENST00000576502	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.78	□□□□□ -0.2

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