RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 CHRNA6Q15825 494 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 CFAP58Q5T655 872 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 DOK6Q6PKX4 331 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 LIPIQ6XZB0 460 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 NT5C3BQ969T7 300 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 LHX3Q9UBR4 397 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 RAMP2O60895 175 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 NDUFA10O95299 355 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 EML2O95834 649 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 ELFN1P0C7U0 828 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 USP8P40818 1118 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 RAB6CQ53S08 254 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 NLRP14Q86W24 1093 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 MAGEH1Q9H213 219 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 SYNCQ9H7C4 482 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FBN3Q75N90 2809 aa14.74□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 A6NL46 340 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FAM72CH0Y354 149 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 LRRTM2O43300 516 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 ZG16O60844 167 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 F9P00740 461 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PRCPP42785 496 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FASLGP48023 281 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 MAPKAPK2P49137 400 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 SEPHS1P49903 392 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 GFERP55789 205 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 ITGA1P56199 1179 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 IL10RAQ13651 578 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 CYTH1Q15438 398 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 UGT8Q16880 541 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FAM72BQ86X60 149 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 OR6C1Q96RD1 312 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 TSG101Q99816 390 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 NUDT9Q9BW91 350 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 USP25Q9UHP3 1055 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PADI1Q9ULC6 663 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 SVILO95425 2214 aa14.73□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 RHOQP17081 205 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FLT3P36888 993 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PTGIRP43119 386 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 RAPSNQ13702 412 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 TRNP1Q6NT89 227 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 GJB7Q6PEY0 223 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 TEX101Q9BY14 249 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 LHX9Q9NQ69 397 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.72□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 BECN2A8MW95 431 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 F5H423 210 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 ZNF185O15231 689 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 PMM2O15305 246 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 RECKO95980 971 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 CDK3Q00526 305 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 HHEXQ03014 270 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 MANEALQ5VSG8 457 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 DENND2CQ68D51 928 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP15-216ENST00000550632 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms