RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546378.1

HOXC11-202, Transcript of homeobox C11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC11, Length 3,261 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-202ENST00000546378 NME4O00746 187 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ESRRBO95718 433 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 GSNP06396 782 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 MYL4P12829 197 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 NPR3P17342 541 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ARSDP51689 593 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 MUS81Q96NY9 551 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 NAT9Q9BTE0 207 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 TRIM17Q9Y577 477 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 H3BNH8 94 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ACOT8O14734 319 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ATICP31939 592 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 RMDN1Q96DB5 314 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 PCED1BQ96HM7 432 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 CAPNS2Q96L46 248 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 HPS4Q9NQG7 708 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 C5orf42Q9H799 3197 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 GSTA4O15217 222 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 CA12O43570 354 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 FSHRP23945 695 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 NOS2P35228 1153 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 PGFP49763 221 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 CASP9P55211 416 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 FCGRTP55899 365 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 RHDQ02161 417 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 GTF2H3Q13889 308 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 SPESP1Q6UW49 350 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 SLC15A4Q8N697 577 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ASB9Q96DX5 294 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 C19orf60Q96EN9 201 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 TNIP3Q96KP6 325 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 TMEM209Q96SK2 561 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 IL22Q9GZX6 179 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 MYO7AQ13402 2215 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 SYCE1LA8MT33 242 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ALDH1A2O94788 518 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 CAPN3P20807 821 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 DMPKQ09013 629 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 MERTKQ12866 999 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 GLMNQ92990 594 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 TEX37Q96LM6 180 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 TCF12Q99081 682 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 HACD3Q9P035 362 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ARL5AQ9Y689 179 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 HTTP42858 3142 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 IQCF5A8MTL0 148 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 J3KR12 359 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 BCL10O95999 233 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 GRIK1P39086 918 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 MASP1P48740 699 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 PSEN2P49810 448 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 EMP3P54852 163 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 WNT3AP56704 352 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 INPP5AQ14642 412 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 TGFBIQ15582 683 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 TAC4Q86UU9 113 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 OR2T34Q8NGX1 318 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 OR2T3Q8NH03 318 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 RDH11Q8TC12 318 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 FNDC8Q8TC99 324 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 TRIB2Q92519 343 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 RTP4Q96DX8 246 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-202ENST00000546378 A0A087WXM4 84 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC11-202ENST00000546378 AXIN1O15169 862 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC11-202ENST00000546378 HLA-DQB2P05538 268 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC11-202ENST00000546378 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXC11-202ENST00000546378 TGFBR1P36897 503 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC11-202ENST00000546378 GRM5P41594 1212 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC11-202ENST00000546378 LILRA4P59901 499 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC11-202ENST00000546378 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms