RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 ACDQ96AP0 544 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 VOPP1Q96AW1 172 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 RMDN1Q96DB5 314 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 MOCOSQ96EN8 888 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 RILPQ96NA2 401 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 ADGRE3Q9BY15 652 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 COG4Q9H9E3 785 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 TAS2R1Q9NYW7 299 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 HACD3Q9P035 362 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 ARMCX1Q9P291 453 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 VPS28Q9UK41 221 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 MED16Q9Y2X0 877 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 MYO9BQ13459 2157 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PRU2 124 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM86C2PA6NEL3 165 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 C2orf81A6NN90 581 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 SOBPA7XYQ1 873 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 HIDE1A8MVS5 230 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 K7ERQ8 282 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 GSC2O15499 205 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 PGLSO95336 258 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 PIGNO95427 931 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 PENKP01210 267 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 CKMP06732 381 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 CHRNGP07510 517 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS56P0CW18 603 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC166P0CW27 439 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 GJA1P17302 382 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 TFEBP19484 476 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 CD9P21926 228 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 MPSTP25325 297 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 PLA2G5P39877 138 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 CCR10P46092 362 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNC1P48547 511 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL14P50914 215 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 RHOAP61586 193 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 LMAN2Q12907 356 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 USP4Q13107 963 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 CDH18Q13634 790 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 SNCBQ16143 134 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 METTL21CQ5VZV1 264 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 RETSATQ6NUM9 610 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 ISCA2Q86U28 154 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 MFN1Q8IWA4 741 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 KDM1BQ8NB78 822 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 PIH1D2Q8WWB5 315 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 LPGAT1Q92604 370 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC126Q96EE4 140 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 CNDP1Q96KN2 507 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 C19orf43Q9BQ61 176 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 TCF25Q9BQ70 676 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 CORO1BQ9BR76 489 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 GPAMQ9HCL2 828 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCB8Q9NUT2 735 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 IL17CQ9P0M4 197 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 TAGLN3Q9UI15 199 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 A8MT66 165 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 A8MUI8 341 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 SLCO1B7G3V0H7 640 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 HDAC3O15379 428 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CCL16O15467 120 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 FGF19O95750 216 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 GLUD1P00367 558 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CD1DP15813 335 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNA5P22460 613 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CD70P32970 193 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 ABL2P42684 1182 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CLCN4P51793 760 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL26P61254 145 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP8P85298 464 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 XIAPP98170 497 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 PEX6Q13608 980 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPRRQ15256 657 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CDKN3Q16667 212 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHG6Q3KR16 790 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 PPM1LQ5SGD2 360 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 WASHC2DQ5SRD0 308 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR158Q5T848 1215 aa10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms