RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CD84Q9UIB8 345 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CLCA2Q9UQC9 943 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CPED1A4D0V7 1026 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 TAF4O00268 1085 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 TNFRSF10CO14798 259 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 OPA1O60313 960 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 TGM2P21980 687 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 NR2C2P49116 596 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 PTSQ03393 145 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 ADCY2Q08462 1091 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 TFDP3Q5H9I0 405 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 RFLNAQ6ZTI6 216 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 GKN2Q86XP6 184 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC50Q8IVM0 306 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 GLMNQ92990 594 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 TEX101Q9BY14 249 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 SIRPGQ9P1W8 387 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 MOSPD1Q9UJG1 213 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 DNPEPQ9ULA0 475 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 DUSP10Q9Y6W6 482 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 PRSS38A1L453 326 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 MT-CO3P00414 261 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 RPIAP49247 311 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 STC1P52823 247 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CDK3Q00526 305 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 DPTQ07507 201 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CYP4F3Q08477 520 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 QPCTQ16769 361 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 LVRNQ6Q4G3 990 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 NT5DC3Q86UY8 548 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM139Q8IV31 216 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 RCOR2Q8IZ40 523 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 KYQ8NBH2 561 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 EXD1Q8NHP7 514 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 MAPK15Q8TD08 544 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 HAUS1Q96CS2 278 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 LYSMD1Q96S90 227 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 LACRTQ9GZZ8 138 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 ABCG8Q9H221 673 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CYP4F12Q9HCS2 524 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 GPR34Q9UPC5 381 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 BTNL10A8MVZ5 291 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CLDN7O95471 211 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 SOD1P00441 154 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 PTPN3P26045 913 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 TEAD1P28347 426 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CDC25BP30305 580 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 GPR1P46091 355 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 VAV2P52735 878 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 GALNT3Q14435 633 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 PERM1Q5SV97 790 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CDCP2Q5VXM1 449 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF765Q7L2R6 523 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 ARL10Q8N8L6 244 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 SPC24Q8NBT2 197 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 P3H4Q92791 437 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 SCAMP4Q969E2 229 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 AP2M1Q96CW1 435 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 NXPE2Q96DL1 559 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM168Q9H0V1 697 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 ABCG4Q9H172 646 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 SLC25A51Q9H1U9 297 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 GULP1Q9UBP9 304 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 DKK4Q9UBT3 224 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 PADI4Q9UM07 663 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 ANKRD66B4E2M5 251 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 PPP2R5EQ16537 467 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 TEX44Q53QW1 395 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 KDELC2Q7Z4H8 507 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 TAF8Q7Z7C8 310 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-202ENST00000498438 NAT6Q93015 286 aa18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms