RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CNTN1Q12860 1018 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SPANXN3Q5MJ09 141 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CERCAMQ5T4B2 595 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SYCP2LQ5T4T6 812 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 AGBL4Q5VU57 503 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TMEM135Q86UB9 458 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 LMNTD2Q8IXW0 634 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 AADATQ8N5Z0 425 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ASB12Q8WXK4 309 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 COL26A1Q96A83 441 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SGSM3Q96HU1 749 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 NEUROG2Q9H2A3 272 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SAYSD1Q9NPB0 183 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PCDH12Q9NPG4 1184 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 RXFP3Q9NSD7 469 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PKP3Q9Y446 797 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZNF711Q9Y462 761 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FADS3Q9Y5Q0 445 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.71□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 LRRC72A6NJI9 287 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 H7C0S8 307 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 NEMP1O14524 444 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 LDB2O43679 373 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 AVILO75366 819 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ELK3P41970 407 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 FAM193AP78312 1265 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CREB5Q02930 508 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ACVR1Q04771 509 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 POU6F1Q14863 301 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 AGERQ15109 404 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CDKN3Q16667 212 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 MAP7D1Q3KQU3 841 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CASC4Q6P4E1 433 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CRTC1Q6UUV9 634 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CYP2U1Q7Z449 544 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 C11orf74Q86VG3 221 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 NLRP8Q86W28 1048 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CCDC25Q86WR0 208 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 PALM2Q8IXS6 379 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 NRSN1Q8IZ57 195 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 PGBD3Q8N328 593 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TTC30BQ8N4P2 665 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CXorf40AQ8TE69 158 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 GANCQ8TET4 914 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 HMGB4Q8WW32 186 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 BTBD1Q9H0C5 482 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 PKD2L2Q9NZM6 624 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 B4GALT6Q9UBX8 382 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 APPL1Q9UKG1 709 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 FAM169AQ9Y6X4 670 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PP55 124 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 PYGLP06737 847 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ELFN1P0C7U0 828 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TPH1P17752 444 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CTPS1P17812 591 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ABL2P42684 1182 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TPMTP51580 245 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 STC1P52823 247 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 PMS2P54278 862 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 DCDC1P59894 354 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 RPS21P63220 83 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 OLIG2Q13516 323 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 MSS51Q4VC12 460 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 STEAP4Q687X5 459 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 LIPIQ6XZB0 460 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 SLC36A4Q6YBV0 504 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ZNF765Q7L2R6 523 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 MREGQ8N565 214 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms