RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 ESR1P03372 595 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 LIMK2P53671 638 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 CYP2A13Q16696 494 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 RAB6CQ53S08 254 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 HECTD2Q5U5R9 776 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.27□□□□□ -1.09
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PTPRD-211ENST00000486161 TMEM25Q86YD3 366 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 REPS1Q96D71 796 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 CEP44Q9C0F1 390 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 POMKQ9H5K3 350 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 NPC1O15118 1278 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 LILRB3O75022 631 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 SLC1A6P48664 564 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 PLK1P53350 603 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 PFKFB4Q16877 469 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.27□□□□□ -1.09
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF366Q8N895 744 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 PHC3Q8NDX5 983 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 HMGB4Q8WW32 186 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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PTPRD-211ENST00000486161 ACOX2Q99424 681 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 RBBP8Q99708 897 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 TNFRSF10BO14763 440 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRD-211ENST00000486161 GSRP00390 522 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 C2P06681 752 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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PTPRD-211ENST00000486161 NSG1P42857 185 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 KCNK10P57789 538 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRD-211ENST00000486161 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 MID1IP1Q9NPA3 183 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 AHSPQ9NZD4 102 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 FETUBQ9UGM5 382 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 FPGTO14772 594 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 PIGNO95427 931 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 VIPR1P32241 457 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRD-211ENST00000486161 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRD-211ENST00000486161 H0YGN5 161 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRD-211ENST00000486161 FSBPO95073 299 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 ADH1BP00325 375 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRD-211ENST00000486161 SLC8A1P32418 973 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 DGKEP52429 567 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRD-211ENST00000486161 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 INPP5DQ92835 1189 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 ERP27Q96DN0 273 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.26□□□□□ -1.09
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