RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CRHR1P34998 444 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CLCN5P51795 746 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PEX6Q13608 980 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SNX32Q86XE0 403 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TOP1MTQ969P6 601 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC22A12Q96S37 553 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TLR9Q9NR96 1032 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ETAA1Q9NY74 926 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 UBDO15205 165 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 FGFR3P22607 806 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CAP1Q01518 475 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CREMQ03060 361 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ABRQ12979 859 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ERAP2Q6P179 960 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM159Q96B96 161 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PLD4Q96BZ4 506 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC126Q96EE4 140 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 EBF3Q9H4W6 596 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TDP1Q9NUW8 608 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 MARCH5Q9NX47 278 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TIMM22Q9Y584 194 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TIMP1P01033 207 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CA3P07451 260 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CHRNGP07510 517 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ATF6P18850 670 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PKNOX1P55347 436 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SERINC3Q13530 473 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TDRPQ86YL5 185 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF398Q8TD17 642 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ACMSDQ8TDX5 336 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SYCE1LA8MT33 242 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 NIPSNAP2O75323 286 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 EPHX1P07099 455 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TTPAP49638 278 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGAP8P85298 464 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CPNE9Q8IYJ1 553 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 BRSK1Q8TDC3 778 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ELMO1Q92556 727 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 KLK6Q92876 244 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 RAD9AQ99638 391 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ING2Q9H160 280 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PRSS56P0CW18 603 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CCR10P46092 362 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CDK7P50613 346 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CCNG1P51959 295 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 DMPKQ09013 629 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 NAB1Q13506 487 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CRY1Q16526 586 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 EBF4Q9BQW3 602 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ACAT2Q9BWD1 397 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 MTG2Q9H4K7 406 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms