RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473883.5

HCLS1-205, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 2,710 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-205	ENST00000473883	NXPE2	Q96DL1	559 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	LURAP1	Q96LR2	239 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	ZBTB18	Q99592	522 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	FAM205C	A6NFA0	338 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CYP26A1	O43174	497 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	PEX10	O60683	326 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	RASAL1	O95294	804 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	DEXI	O95424	95 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	RAB3D	O95716	219 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CYP2D6	P10635	497 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	IL12A	P29459	219 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	ADRA1B	P35368	520 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	GRM5	P41594	1212 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	AP1S1	P61966	158 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	PEX6	Q13608	980 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	TBCC	Q15814	346 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	HLF	Q16534	295 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	DPYSL2	Q16555	572 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CENPU	Q71F23	418 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CCDC103	Q8IW40	242 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	RFK	Q969G6	155 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	BDH2	Q9BUT1	245 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	KCNH6	Q9H252	994 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	POLL	Q9UGP5	575 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	FAM187A	A6NFU0	413 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	LILRB5	O75023	590 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	TNFRSF21	O75509	655 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	DLGAP3	O95886	979 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	NFKB1	P19838	968 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CD40LG	P29965	261 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	MAGEA1	P43355	309 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	ACTR2	P61160	394 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	PPIL2	Q13356	520 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	DLGAP5	Q15398	846 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	TEAD4	Q15561	434 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	UCK2	Q9BZX2	261 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	KLHL1	Q9NR64	748 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	SCML1	Q9UN30	329 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CSAD	Q9Y600	493 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883		H7C0S8	307 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	ZNF197	O14709	1029 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CST8	O60676	142 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	TNNC2	P02585	160 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	PGR	P06401	933 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	SLC2A4	P14672	509 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	PTGDR	Q13258	359 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	BMPR2	Q13873	1038 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	KLHL12	Q53G59	568 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	ELP2	Q6IA86	826 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	DESI1	Q6ICB0	168 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CHSY3	Q70JA7	882 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	SSX9	Q7RTT3	188 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CABP5	Q9NP86	173 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	POLE4	Q9NR33	117 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CHD4	Q14839	1912 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	E2F8	A0AVK6	867 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HCLS1-205	ENST00000473883	CABYR	O75952	493 aa		12.67	□□□□□ -0.38

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