RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465848.1

DEGS1-204, Transcript of delta 4-desaturase, sphingolipid 1, humanhuman

TSL 2

Gene DEGS1, Length 633 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEGS1-204ENST00000465848 DDAH2O95865 285 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 PNPP00491 289 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 ENO1P06733 434 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 ACTN1P12814 892 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 PDGFRAP16234 1089 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 PTPN2P17706 415 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
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DEGS1-204ENST00000465848 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.57□□□□□ -1.84
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DEGS1-204ENST00000465848 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 KLHL7Q8IXQ5 586 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 TSPAN14Q8NG11 270 aa3.57□□□□□ -1.84
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DEGS1-204ENST00000465848 RFKQ969G6 155 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 KAZALD1Q96I82 304 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 CEP295NLQ96MC4 621 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
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DEGS1-204ENST00000465848 MMS19Q96T76 1030 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 ADAM2Q99965 735 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.57□□□□□ -1.84
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DEGS1-204ENST00000465848 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3.57□□□□□ -1.84
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DEGS1-204ENST00000465848 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
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DEGS1-204ENST00000465848 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
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DEGS1-204ENST00000465848 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 LIPGQ9Y5X9 500 aa3.57□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
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DEGS1-204ENST00000465848 A0A0A0MQY5 61 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 A0A1W2PR77 199 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 LNP1A1A4G5 178 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
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DEGS1-204ENST00000465848 HSPA4P34932 840 aa3.56□□□□□ -1.84
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DEGS1-204ENST00000465848 SLC12A3P55017 1021 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 CXCL9Q07325 125 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 TP53BP2Q13625 1128 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 PTPRRQ15256 657 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 CDONQ4KMG0 1287 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 KRT39Q6A163 491 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 GALNT17Q6IS24 598 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 WDR73Q6P4I2 378 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 GBP6Q6ZN66 633 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.56□□□□□ -1.84
DEGS1-204ENST00000465848 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
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