RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460211.5

ATG4B-213, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-213ENST00000460211 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 SLC25A45Q8N413 288 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TTC13Q8NBP0 860 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 OR4C6Q8NH72 309 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 LMX1AQ8TE12 382 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ALG3Q92685 438 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 DTD2Q96FN9 168 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TBATAQ96M53 351 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 WDR92Q96MX6 357 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.021e-11■■□□□ 12.1
ATG4B-213ENST00000460211 WDR26Q9H7D7 661 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 KLQ9UEF7 1012 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 OR1A2Q9Y585 309 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TMEM131Q92545 1883 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ACACAQ13085 2346 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 BPTFQ12830 3046 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 FAM149AA5PLN7 773 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 FFAR2O15552 330 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 AQP9O43315 295 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 RASGRP1O95267 797 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TNFP01375 233 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 PYGLP06737 847 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 C1SP09871 688 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 CTSEP14091 401 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TSHRP16473 764 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 CKMT2P17540 419 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TRIM23P36406 574 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ETV3P41162 512 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 KIAA1024LP59773 190 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 DAB2P98082 770 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 CDK18Q07002 472 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 CYP4F3Q08477 520 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 WASHC5Q12768 1159 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 IHHQ14623 411 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 PCSK7Q16549 785 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 QPCTQ16769 361 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 Q6ZVL8 140 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ACTL9Q8TC94 416 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 CRELD1Q96HD1 420 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 LYSMD1Q96S90 227 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 A0A0U1RQJ8 604 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TPP1O14773 563 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TNFRSF10CO14798 259 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 SIGLEC6O43699 453 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 PMPCBO75439 489 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ANXA6P08133 673 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TEAD1P28347 426 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 GPR1P46091 355 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 HK3P52790 923 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 STC1P52823 247 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 PTSQ03393 145 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 DPTQ07507 201 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ILKQ13418 452 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 NLRP8Q86W28 1048 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 HID1Q8IV36 788 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms