RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF384Q8TF68 577 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GPRASP2Q96D09 838 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 C5orf34Q96MH7 638 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MED18Q9BUE0 208 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ACTR6Q9GZN1 396 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 AASSQ9UDR5 926 aa5.6□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 ERVV-2B6SEH9 535 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A2O15244 555 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 PAX6P26367 422 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TYK2P29597 1187 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PRDX6P30041 224 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 HMGCLP35914 325 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 NFATC3Q12968 1075 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 CYB5R2Q6BCY4 276 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A25Q6KCM7 469 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF781Q8N8C0 355 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 P2RX5Q93086 422 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ARMC5Q96C12 935 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GAREM1Q9H706 876 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GGA1Q9UJY5 639 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GPR34Q9UPC5 381 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 JAG2Q9Y219 1238 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ATP8B3O60423 1300 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 AGRPO00253 132 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ANXA1P04083 346 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 FDX1P10109 184 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 ITKQ08881 620 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 ADGRE1Q14246 886 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 ATG9BQ674R7 924 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CHSY3Q70JA7 882 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 PDZD9Q8IXQ8 264 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TLCD1Q96CP7 247 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLC47A1Q96FL8 570 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RIPOR3Q96MK2 946 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 CABP2Q9NPB3 220 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 EXTL2Q9UBQ6 330 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLC7A8Q9UHI5 535 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A0B4J269 797 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CIB4A0PJX0 185 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TGOLN2O43493 480 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 B4GALT4O60513 344 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SMPD2O60906 423 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CYP7B1O75881 506 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 OLFM2O95897 454 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 IFNA17P01571 189 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 STOMP27105 288 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PPM1AP35813 382 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TUBB3Q13509 450 aa5.59□□□□□ -1.51
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