RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 A8MUI8 341 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 B8ZZF3 427 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 LEFTY1O75610 366 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ANXA6P08133 673 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CCKBRP32239 447 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 PRKCIP41743 596 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 PTPN9P43378 593 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 NME3Q13232 169 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CFAP58Q5T655 872 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC63Q8NA47 563 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 NTAN1Q96AB6 310 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 PIGVQ9NUD9 493 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 TSPAN11A1L157 253 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CBX4O00257 560 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 E2F6O75461 281 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 LCA5LO95447 670 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 JUNDP17535 347 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 DESP17661 470 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CSNK1DP48730 415 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 THOP1P52888 689 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 KCNJ2P63252 427 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 MANEALQ5VSG8 457 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 WDR59Q6PJI9 974 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 C14orf80Q86SX3 495 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 GKN2Q86XP6 184 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ARL10Q8N8L6 244 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 RAPGEF5Q92565 580 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 COL26A1Q96A83 441 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CENPTQ96BT3 561 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 A0A1W2PQ67 120 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ESYT3A0FGR9 886 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 WASH4PA8MWX3 477 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 TNFRSF10CO14798 259 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 AREL1O15033 823 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 EPHB6O15197 1021 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 KDELR3O43731 214 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 IGSF6O95976 241 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 TNFAIP3P21580 790 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 DRD4P21917 467 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 NFKBIAP25963 317 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 HTR1BP28222 390 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 JAM2P57087 298 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 CUL3Q13618 768 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 MYBPC3Q14896 1274 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 TAF5Q15542 800 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 TRADDQ15628 312 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 MYLK3Q32MK0 819 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 XYLT1Q86Y38 959 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 SIK2Q9H0K1 926 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 SIX2Q9NPC8 291 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 INTUQ9ULD6 942 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 NFU1Q9UMS0 254 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 ITM2BQ9Y287 266 aa6.05□□□□□ -1.44
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