RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.97■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 DPEP2Q9H4A9 486 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 LRIT1Q9P2V4 623 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 NENFQ9UMX5 172 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 CEACAM5P06731 702 aa20.96■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF438Q7Z4V0 828 aa20.96■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 CD48P09326 243 aa20.95■□□□□ 0.94
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 TTC9Q92623 222 aa20.95■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 NT5MQ9NPB1 228 aa20.95■□□□□ 0.94
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LIMS1-208ENST00000428064 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
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LIMS1-208ENST00000428064 SUFUQ9UMX1 484 aa20.94■□□□□ 0.94
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LIMS1-208ENST00000428064 SOD1P00441 154 aa20.93■□□□□ 0.94
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LIMS1-208ENST00000428064 FGF1P05230 155 aa20.93■□□□□ 0.94
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LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20.93■□□□□ 0.94
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LIMS1-208ENST00000428064 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.93■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
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LIMS1-208ENST00000428064 PROSCO94903 275 aa20.92■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 CPNE6O95741 557 aa20.92■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 GNPDA1P46926 289 aa20.92■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 NFKBIBQ15653 356 aa20.92■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.92■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC66Q68CR7 880 aa20.92■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.92■□□□□ 0.94
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LIMS1-208ENST00000428064 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
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