RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400593.6

TPTEP1-202, Transcript of TPTE pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TPTEP1, Length 1,430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP1-202ENST00000400593 LRRC66Q68CR7 880 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 C11orf74Q86VG3 221 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 HOOK3Q86VS8 718 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 ZNF711Q9Y462 761 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 LAMA1P25391 3075 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 A0A1W2PQU0 124 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 CCDC78A2IDD5 438 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 FSBPO95073 299 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 BCKDHBP21953 392 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 MGAT1P26572 445 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 NPY2RP49146 381 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 PTSQ03393 145 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 ARHGEF7Q14155 803 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 PTPRCAPQ14761 206 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 CNGA3Q16281 694 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 CDKN3Q16667 212 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 LIPIQ6XZB0 460 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 SEC14L1Q92503 715 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 ART4Q93070 314 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 SERPINB12Q96P63 405 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 PREBQ9HCU5 417 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 BPIFA1Q9NP55 256 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 BFARQ9NZS9 450 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 ARL5AQ9Y689 179 aa15.94■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 THADAQ6YHU6 1953 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 MYLKQ15746 1914 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 CEP192Q8TEP8 1941 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 SMAPO00193 183 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 AP3B1O00203 1094 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 HRO43593 1189 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 BANF1O75531 89 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 ELFN1P0C7U0 828 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 CNR2P34972 360 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 CARSP49589 748 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 LIMK1P53667 647 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 PPP2CBP62714 309 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 PPP2CAP67775 309 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 ACOX1Q15067 660 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 BBS9Q3SYG4 887 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 MSS51Q4VC12 460 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 NEK5Q6P3R8 708 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 ZDHHC24Q6UX98 284 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 MPP5Q8N3R9 675 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 FBXO25Q8TCJ0 367 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 BRSK1Q8TDC3 778 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 UBXN4Q92575 508 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 EID2BQ96D98 161 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 LYSMD1Q96S90 227 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 PCED1AQ9H1Q7 454 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 FAM114A2Q9NRY5 505 aa15.93■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.141e-7■■□□□ 12.8
TPTEP1-202ENST00000400593 LOC400499M0QZD8 3231 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 TM4SF5O14894 197 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 KCNK5O95279 499 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 C6P13671 934 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 ARL4CP56559 192 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 CASC4Q6P4E1 433 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 SLC36A4Q6YBV0 504 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 TMC3Q7Z5M5 1100 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 HORMAD1Q86X24 394 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 IFT20Q8IY31 132 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 TMEFF1Q8IYR6 380 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 TTC30BQ8N4P2 665 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 GDF3Q9NR23 364 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 SYBUQ9NX95 663 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 HACD3Q9P035 362 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 CD84Q9UIB8 345 aa15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 SDR42E2A6NKP2 422 aa15.91■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 C2orf81A6NN90 581 aa15.91■□□□□ 0.14
TPTEP1-202ENST00000400593 SLC31A1O15431 190 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms