RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 TEX47Q8TBZ9 253 aa18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 B3GNT5Q9BYG0 378 aa18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 C5orf60A6NFR6 353 aa18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 KELP23276 732 aa18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SP100P23497 879 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 USP4Q13107 963 aa18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PARP15Q460N3 678 aa18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 NETO2Q8NC67 525 aa18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PCDHB18PQ96TA0 734 aa18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.51■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TAF10Q12962 218 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CXCL14O95715 111 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 DBTP11182 482 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 DUSP4Q13115 394 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 NOGQ13253 232 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 GPR20Q99678 358 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 RPP40O75818 363 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 COL6A2P12110 1019 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 RGS21Q2M5E4 152 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CRTC3Q6UUV7 619 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CPXM1Q96SM3 734 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TEX28O15482 410 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 LGALS3BPQ08380 585 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SEMA5AQ13591 1074 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 GALNT18Q6P9A2 607 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 C17orf64Q86WR6 236 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 C3orf14Q9HBI5 128 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 A0A1W2PQH9 124 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SLURP2P0DP57 97 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SLC44A1Q8WWI5 657 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SLC17A7Q9P2U7 560 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 GRM6O15303 877 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SLC28A2O43868 658 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 NRP2O60462 931 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CILPO75339 1184 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 HSDL1Q3SXM5 330 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 LLGL2Q6P1M3 1020 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 DEF8Q6ZN54 512 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 OR2T12Q8NG77 320 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 KLRG1Q96E93 195 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 EGFL7Q9UHF1 273 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 DNTTP04053 509 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 NR2F6P10588 404 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 GLUD2P49448 558 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 DEFB115Q30KQ5 88 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 XYLT1Q86Y38 959 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CFAP52Q8N1V2 620 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 RASGEF1CQ8N431 466 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 OR6K2Q8NGY2 324 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 OR10G6Q8NH81 332 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 FAM84AQ96KN4 292 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 RTKNQ9BST9 563 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 ACAT2Q9BWD1 397 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 ABCG8Q9H221 673 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 KCTD5Q9NXV2 234 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 UBAP1Q9NZ09 502 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 UBE2QL1A1L167 161 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 AGRPO00253 132 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 FKTNO75072 461 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 FGF19O95750 216 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SSR2P43308 183 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 LSM3P62310 102 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MOB2Q70IA6 237 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 BCL2L14Q9BZR8 327 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TGDSO95455 350 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MYL9P24844 172 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 KLHL12Q53G59 568 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 RPTNQ6XPR3 784 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SPATA19Q7Z5L4 167 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SAPCD2Q86UD0 394 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MAB21L3Q8N8X9 362 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 OR4A15Q8NGL6 344 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MAT2BQ9NZL9 334 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 H3BNH8 94 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms