RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPINT3P49223 89 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FNTAP49354 379 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA1024LP59773 190 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCDC1P59894 354 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ETF1P62495 437 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INAVAQ3KP66 663 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM182AQ5T1J6 154 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DENND2CQ68D51 928 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCTD11Q693B1 232 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNCKQ6P2M8 343 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MACC1Q6ZN28 852 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSTA5Q7RTV2 222 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00523Q86TU6 105 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MS4A14Q96JA4 679 aa15.27■□□□□ 0.04
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APOOQ9BUR5 198 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FICDQ9BVA6 458 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR26Q9H7D7 661 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TM4SF5O14894 197 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE1BQ01064 536 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEMA5AQ13591 1074 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FZD2Q14332 565 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NFATC4Q14934 902 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPRRQ15256 657 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A41Q8N5S1 370 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AP2M1Q96CW1 435 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM14Q96QK8 99 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCG8Q9H221 673 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL21RQ9HBE5 538 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 E7EVH7 732 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BM21 787 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFRSF10CO14798 259 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FLRT2O43155 660 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHF2O75151 1096 aa15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSF2P04141 144 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHRNA4P43681 627 aa15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAET1GQ6H3X3 334 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2I1PQ8NGU4 316 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRK7Q8WTQ7 553 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RUNDC3BQ96NL0 473 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AP1M1Q9BXS5 423 aa15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM83DQ9H4H8 585 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ETNK1Q9HBU6 452 aa15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB6BQ9NRW1 208 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHOC2Q9UQ13 582 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1A2Q9Y585 309 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FRYLO94915 3013 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2orf81A6NN90 581 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AP3B1O00203 1094 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF185O15231 689 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRTAMO95727 393 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAS8O95995 478 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TUBB4AP04350 444 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIRTP0C851 137 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD59P13987 128 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL22P35268 128 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAFAH1B1P43034 410 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRK6P43250 576 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR1P46091 355 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNJ1P48048 391 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK16Q00536 496 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
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