RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384017.1

RNU6-620P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 620, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-620P, Length 96 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-620P-201ENST00000384017 TOR1BO14657 336 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 EMC8O43402 210 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 TRIAP1O43715 76 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 TLR5O60602 858 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 CLPTM1O96005 669 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 RAF1P04049 648 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 FESP07332 822 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 IFITM1P13164 125 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 APEHP13798 732 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 TFEBP19484 476 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 LPOP22079 712 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 LONP1P36776 959 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 TPTEP56180 551 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 ERVK-16P61578 105 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 EHHADHQ08426 723 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 KCNB1Q14721 858 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 RPS6KA1Q15418 735 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 TECRLQ5HYJ1 363 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 ISM2Q6H9L7 571 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 ZNF880Q6PDB4 577 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 SLC4A10Q6U841 1118 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 TMEM108Q6UXF1 575 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 BBS12Q6ZW61 710 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 RABEPKQ7Z6M1 372 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 LINC01465Q8N7H1 131 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 KAT2AQ92830 837 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 CHAMP1Q96JM3 812 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 USP28Q96RU2 1077 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 FAM173AQ9BQD7 235 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 CEP44Q9C0F1 390 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 ADNPQ9H2P0 1102 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 HIPK3Q9H422 1215 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 IL20RAQ9UHF4 553 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 GABRQQ9UN88 632 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 DUSP12Q9UNI6 340 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 UTYO14607 1347 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 A0A096LPK6 155 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 E7EQL1 145 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 M0R2C6 588 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 ACTL6BO94805 426 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 POMCP01189 267 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 CD4P01730 458 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 ICAM1P05362 532 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 CD247P20963 164 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 GNLYP22749 145 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 PAX3P23760 479 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 IDUAP35475 653 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 GGT5P36269 586 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 LIFRP42702 1097 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 SERPINB8P50452 374 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 EFNA3P52797 238 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 POLE2P56282 527 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 PER3P56645 1201 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 AMPD2Q01433 879 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 ZNF154Q13106 437 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 TNFAIP1Q13829 316 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 SEPT6Q14141 434 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 MOGAT2Q3SYC2 334 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 TSPO2Q5TGU0 170 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 PGBD2Q6P3X8 592 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 C16orf87Q6PH81 154 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 TPTE2Q6XPS3 522 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 KCTD8Q6ZWB6 473 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 CATSPERDQ86XM0 798 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 CCDC103Q8IW40 242 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 RNF149Q8NC42 400 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 GPR119Q8TDV5 335 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 ROBO4Q8WZ75 1007 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 TMIGD2Q96BF3 282 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 SCRN2Q96FV2 425 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 TXNDC15Q96J42 360 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 ZNF75AQ96N20 296 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 OR1F2PQ96R84 312 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 JAM3Q9BX67 310 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 CLEC7AQ9BXN2 247 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 FUT8Q9BYC5 575 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-620P-201ENST00000384017 ZNF287Q9HBT7 754 aa-3□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms