RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 C9IYK1 514 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MEIS2O14770 477 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 KPNA5O15131 536 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 UGT2B4P06133 528 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ALADP13716 330 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 BMP7P18075 431 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GJA9P57773 515 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ALG11Q2TAA5 492 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 METTL21CQ5VZV1 264 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GPR135Q8IZ08 494 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 QRFPRQ96P65 431 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 NEK6Q9HC98 313 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GNB5O14775 395 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PER2O15055 1255 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 DCLK1O15075 740 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC31A1O15431 190 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ITGA2BP08514 1039 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 UGT2B15P54855 530 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FMO1Q01740 532 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 OR52J3Q8NH60 311 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PXDNQ92626 1479 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM227AF5H4B4 570 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SQLEQ14534 574 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 COPS4Q9BT78 406 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SIN3BO75182 1162 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 HNMTP50135 292 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 EBPLQ9BY08 206 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PPP2R2BQ00005 443 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 BST1Q10588 318 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 LRP8Q14114 963 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GRB14Q14449 540 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 KCNA10Q16322 511 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC20A2Q08357 652 aa14.71□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TAF10Q12962 218 aa14.71□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.71□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MTMR9Q96QG7 549 aa14.71□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 AREL1O15033 823 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 NT5EP21589 574 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 GPM6BQ13491 265 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CERS5Q8N5B7 392 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 POC5Q8NA72 575 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM110BQ8TC76 370 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 STK32AQ8WU08 396 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CSH1P0DML2 217 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CSH2P0DML3 217 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MPSTP25325 297 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ABATP80404 500 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MAP2K5Q13163 448 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SETD6Q8TBK2 473 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PPCDCQ96CD2 204 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TPK1Q9H3S4 243 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PIK3C2BO00750 1634 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SSR2P43308 183 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms