RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364234.1

RNU6-11P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 11, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-11P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-11P-201ENST00000364234 EFNB3Q15768 340 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 ASIC2Q16515 512 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 CTF1Q16619 201 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 ALG11Q2TAA5 492 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 MMEL1Q495T6 779 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 SLC45A4Q5BKX6 768 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 HAUS3Q68CZ6 603 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 ANKRD54Q6NXT1 300 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMEM154Q6P9G4 183 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 QSOX2Q6ZRP7 698 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 PXKQ7Z7A4 578 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 PDILTQ8N807 584 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZNF114Q8NC26 417 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 CREB3L4Q8TEY5 395 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMED6Q8WW62 240 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 ARHGEF26Q96DR7 871 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 CCDC34Q96HJ3 373 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 TIGD1Q96MW7 591 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 FIZ1Q96SL8 496 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 HAUS8Q9BT25 410 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 TKTL2Q9H0I9 626 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 LTB4R2Q9NPC1 389 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 KRT84Q9NSB2 600 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 ABI3Q9P2A4 366 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 MKLN1Q9UL63 735 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 SNX9Q9Y5X1 595 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 PSAT1Q9Y617 370 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 MAU2Q9Y6X3 613 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 PI4KAP2A4QPH2 592 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 MAGEA13PA6NCF6 341 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 LIPT2A6NK58 231 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 C4orf47A7E2U8 309 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 MYO1GB0I1T2 1018 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 HCRTR2O43614 444 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 USO1O60763 962 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZBED4O75132 1171 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 NDUFS7O75251 213 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 RFPL2O75678 378 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMEM11P17152 192 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 ITGB6P18564 788 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 TNFRSF8P28908 595 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 CCKBRP32239 447 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 PRCPP42785 496 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 COMPP49747 757 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 CLCNKAP51800 687 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 DCAF7P61962 342 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 FOXM1Q08050 763 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 LRMPQ12912 555 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 DLG1Q12959 904 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 MYBPHQ13203 477 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 TNFAIP1Q13829 316 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 NFATC4Q14934 902 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 SLC39A14Q15043 492 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 NAB2Q15742 525 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 COL28A1Q2UY09 1125 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 FRG2Q64ET8 278 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 FAM180BQ6P0A1 224 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 PQLC2Q6ZP29 291 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 HAPLN4Q86UW8 402 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 TICAM1Q8IUC6 712 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 PGBD5Q8N414 524 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 KCNH5Q8NCM2 988 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 DNAAF4Q8WXU2 420 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 MOAP1Q96BY2 351 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 BICD1Q96G01 975 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 ADGRG7Q96K78 797 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 ACOX2Q99424 681 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 PCGF1Q9BSM1 259 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 SIL1Q9H173 461 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 IL25Q9H293 177 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 MAGIXQ9H6Y5 334 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 SH2D4AQ9H788 454 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-11P-201ENST00000364234 SCPEP1Q9HB40 452 aa2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms