RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362830.1

RNU6-223P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 223, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-223P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 RBFAQ8N0V3 343 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZBTB2Q8N680 514 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ENGASEQ8NFI3 743 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 POMGNT1Q8WZA1 660 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 WASF1Q92558 559 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 INPP5DQ92835 1189 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ERGIC1Q969X5 290 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 RNF183Q96D59 192 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 PGAM5Q96HS1 289 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 GCNAQ96QF7 691 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SIN3AQ96ST3 1273 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 GAD1Q99259 594 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 KLHL4Q9C0H6 718 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ANKRD2Q9GZV1 360 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 PLK3Q9H4B4 646 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SH2D4AQ9H788 454 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 WWOXQ9NZC7 414 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM169AQ9Y6X4 670 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 UTYO14607 1347 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 A0A096LPK6 155 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 H7C0S8 307 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 I6L893 689 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 J3KR12 359 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SCAMP1O15126 338 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 HCRTR2O43614 444 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 CYC1P08574 325 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 HOXB5P09067 269 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 IRF1P10914 325 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ACADLP28330 430 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 THPOP40225 353 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC15A1P46059 708 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 RFX2P48378 723 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 MFAP4P55083 255 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SORDQ00796 357 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM27E3Q08E93 113 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 CDC16Q13042 620 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 RASA2Q15283 850 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SHBQ15464 509 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 DLG2Q15700 870 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SEPT14Q6ZU15 432 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMC8Q8IU68 726 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 WDR63Q8IWG1 891 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM185AQ8N0U4 392 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 DPP10Q8N608 796 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC41A2Q96JW4 573 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 PAFAH2Q99487 392 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZPBPQ9BS86 351 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SIL1Q9H173 461 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 CDT1Q9H211 546 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 KLHL31Q9H511 634 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 MTMR10Q9NXD2 777 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 OGFRQ9NZT2 677 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 SELENONQ9NZV5 590 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 PCDHA7Q9UN72 937 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 MTMR6Q9Y217 621 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 DOCK7Q96N67 2140 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 A0A1B0GVM2 712 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 TSPY2A6NKD2 308 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 LACTBL1A8MY62 500 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 H0YGN5 161 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-223P-201ENST00000362830 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms