RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0J9YYE9 177 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CPED1A4D0V7 1026 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM202A6NGA9 273 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CAPN8A6NHC0 703 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK1O00180 336 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PSMD11O00231 422 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 APOL1O14791 398 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 YY2O15391 372 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PJA2O43164 708 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PSTPIP1O43586 416 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 FZD6O60353 706 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TRBC1P01850 177 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PDHA1P08559 390 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC175P0C221 793 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TNNT1P13805 278 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CTPS1P17812 591 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CES1P23141 567 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM23P36406 574 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ETV3P41162 512 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 RPIAP49247 311 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 EPHB1P54762 984 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 DSC2Q02487 901 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PTPRRQ15256 657 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC66Q68CR7 880 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 KCTD16Q68DU8 428 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PNCKQ6P2M8 343 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 GKN2Q86XP6 184 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 RFX6Q8HWS3 928 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM139Q8IV31 216 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC8AQ8IWT6 810 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PELI3Q8N2H9 469 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ARL10Q8N8L6 244 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 KYQ8NBH2 561 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 OR56A4Q8NGH8 313 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 OR1E3Q8WZA6 343 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 NAT6Q93015 286 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SCRN2Q96FV2 425 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.182e-6■■■□□ 14.9
SGMS1-201ENST00000361543 LGMNQ99538 433 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ABCG4Q9H172 646 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 HYOU1Q9Y4L1 999 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 DGKBQ9Y6T7 804 aa7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0U1RQS6 177 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS38A1L453 326 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF10CO14798 259 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CSO75390 466 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 MT-CO3P00414 261 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TNFP01375 233 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 JCHAINP01591 159 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF30P17039 623 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 COMTP21964 271 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TGM2P21980 687 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CD86P42081 329 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 DYNLT1P63172 113 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 NIPAL4Q0D2K0 466 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 AP1B1Q10567 949 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB17Q13105 803 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 IHHQ14623 411 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 RTP5Q14D33 572 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PDK1Q15118 436 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PERM1Q5SV97 790 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.65□□□□□ -1.18
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