RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 RGPD5Q99666 1765 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 C5P01031 1676 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 UGT1A9O60656 530 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 38.7
NISCH-201ENST00000345716 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 FAM192AQ9GZU8 254 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 FBXO10Q9UK96 956 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 DHRS12A0PJE2 317 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 CYP7B1O75881 506 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 FOXN2P32314 431 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 CXCR2P25025 360 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 IL10RBQ08334 325 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 ENTPD4Q9Y227 616 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 GRM6O15303 877 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 IRAK2O43187 625 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 TM7SF2O76062 418 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 SULT2A1Q06520 285 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 RINLQ6ZS11 566 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 PIGVQ9NUD9 493 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 CA12O43570 354 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 GSNP06396 782 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 HPS6Q86YV9 775 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 TLL1O43897 1013 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 UGT2B4P06133 528 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 ELFN1P0C7U0 828 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 BLVRAP53004 296 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 EPS8Q12929 822 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 CRHR2Q13324 411 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 RIPK1Q13546 671 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 SIX4Q9UIU6 781 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-201ENST00000345716 DLGAP3O95886 979 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 MAPK9P45984 424 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 MPP5Q8N3R9 675 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 ABCG8Q9H221 673 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 SPESP1Q6UW49 350 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 INSIG1O15503 277 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 GRIA1P42261 906 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 ACAP2Q15057 778 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 NELL1Q92832 810 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 OR52E6Q96RD3 313 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 GUCY1B2O75343 617 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 LRATO95237 230 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 BMP10O95393 424 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 NOVP48745 357 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 THOP1P52888 689 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 TTC23Q5W5X9 447 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 HAPLN3Q96S86 360 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 RHBDL2Q9NX52 303 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 ZNF460Q14592 562 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CDK20Q8IZL9 346 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 PCYT2Q99447 389 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CEP44Q9C0F1 390 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 TIMM22Q9Y584 194 aa20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms