RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314742.12

LINS1-201, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene LINS1, Length 4,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-201ENST00000314742 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 COPS2P61201 443 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 VAMP2P63027 116 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 MZT1Q08AG7 82 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 DYRK1AQ13627 763 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 PAGE2BQ5JRK9 111 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 RRM2BQ7LG56 351 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 VTCN1Q7Z7D3 282 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 OSTM1Q86WC4 334 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 FAM185AQ8N0U4 392 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 RSC1A1Q92681 617 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 P3H4Q92791 437 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 SNF8Q96H20 258 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 MED30Q96HR3 178 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 CEP19Q96LK0 163 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 UBXN6Q9BZV1 441 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 TTYH3Q9C0H2 523 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.681e-8■■■■■ 32
LINS1-201ENST00000314742 PADI2Q9Y2J8 665 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 TRAPPC3O43617 180 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 CILPO75339 1184 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 BMP15O95972 392 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 URODP06132 367 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 COL6A2P12110 1019 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 AGXTP21549 392 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 DNASE1P24855 282 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 FNTAP49354 379 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 OXCT1P55809 520 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 PMPCAQ10713 525 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 IL18Q14116 193 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 MTF1Q14872 753 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 NR0B2Q15466 257 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 CA9Q16790 459 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 INAVAQ3KP66 663 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 FIGNQ5HY92 759 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 WLSQ5T9L3 541 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 SCARA3Q6AZY7 606 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 CLEC9AQ6UXN8 241 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 SPATA19Q7Z5L4 167 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.55□□□□□ -1.68
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LINS1-201ENST00000314742 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 RFT1Q96AA3 541 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 SLC29A1Q99808 456 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 SSX3Q99909 188 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 PRRG3Q9BZD7 231 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 WDR11Q9BZH6 1224 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 KLC2Q9H0B6 622 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 SLC26A1Q9H2B4 701 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 NEK6Q9HC98 313 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 TMEM161AQ9NX61 479 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 A0A1W2PPW3 197 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 A8MUI8 341 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 H0YIN7 160 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 OGTO15294 1046 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 BCL10O95999 233 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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LINS1-201ENST00000314742 TSPAN5P62079 268 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 DUSP4Q13115 394 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 HFEQ30201 348 aa4.55□□□□□ -1.68
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LINS1-201ENST00000314742 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 LRRC38Q5VT99 294 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 CDKAL1Q5VV42 579 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 KLHDC10Q6PID8 442 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 RASAL3Q86YV0 1011 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 HID1Q8IV36 788 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 CCNYL1Q8N7R7 359 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINS1-201ENST00000314742 FSIP1Q8NA03 581 aa4.55□□□□□ -1.68
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