RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.97□□□□□ -0.49
C16orf46-201ENST00000299578 FAM169AQ9Y6X4 670 aa11.97□□□□□ -0.49
C16orf46-201ENST00000299578 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 A0A1W2PQ67 120 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PRR23AA6NEV1 266 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 UPK3BL1B0FP48 263 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 UPK3BL2E5RIL1 263 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 KIAA0754O94854 1291 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PGLSO95336 258 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 CPP00450 1065 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TIMP2P16035 220 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 KRT15P19012 456 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PSMB4P28070 264 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 STX2P32856 288 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 ELK3P41970 407 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TAS2R38P59533 333 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 SEMA5AQ13591 1074 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 UGP2Q16851 508 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PLK5Q496M5 336 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PMS2CLQ68D20 193 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 LPCAT2Q7L5N7 544 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TTC7BQ86TV6 843 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TMEFF1Q8IYR6 380 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 OR2T34Q8NGX1 318 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 FBF1Q8TES7 1133 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 FCRL5Q96RD9 977 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 SMC6Q96SB8 1091 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TRABDQ9H4I3 376 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PREBQ9HCU5 417 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 UBP1Q9NZI7 540 aa11.96□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PLXNA2O75051 1894 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D3EA0A087X179 549 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D3LB9A6J9 549 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 NEMP1O14524 444 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 AP1G1O43747 822 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PMPCBO75439 489 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 BANF1O75531 89 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 RHOBTB1O94844 696 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 APRTP07741 180 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D3HP0C7X1 549 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 NBL1P41271 181 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 MSH2P43246 934 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 SUOXP51687 545 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 CORO7P57737 925 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 ELP6Q0PNE2 266 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PRPSAP1Q14558 356 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PCSK7Q16549 785 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 ERAP2Q6P179 960 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 C6orf89Q6UWU4 347 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 CNPY4Q8N129 248 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 DEFB119Q8N690 84 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 ANKS4BQ8N8V4 417 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 CADM4Q8NFZ8 388 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 SPOCK2Q92563 424 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 TADA1Q96BN2 335 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 CABS1Q96KC9 395 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 HSPA12BQ96MM6 686 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PCDH12Q9NPG4 1184 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 VPS45Q9NRW7 570 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 GGT7Q9UJ14 662 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 RAB23Q9ULC3 237 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 CHMP2BQ9UQN3 213 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 CHKBQ9Y259 395 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 ITM2BQ9Y287 266 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 FADS3Q9Y5Q0 445 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11.95□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 MEI4A8MW99 385 aa11.94□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 AREL1O15033 823 aa11.94□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 SPINT1O43278 529 aa11.94□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 FZD6O60353 706 aa11.94□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 ANXA9O76027 345 aa11.94□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 FSBPO95073 299 aa11.94□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PCDH8O95206 1070 aa11.94□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PRKCGP05129 697 aa11.94□□□□□ -0.5
C16orf46-201ENST00000299578 PDHA1P08559 390 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms