RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 PRMT2P55345 433 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 ASPRV1Q53RT3 343 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 AGAP6Q5VW22 663 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 SUSD4Q5VX71 490 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 GALNT5Q7Z7M9 940 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 TDRPQ86YL5 185 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF34Q8IZ26 560 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 LNX2Q8N448 690 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 CANT1Q8WVQ1 401 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 BTN2A2Q8WVV5 523 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 AGAP4Q96P64 663 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 SNX18Q96RF0 628 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 MMP27Q9H306 513 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 SNX6Q9UNH7 406 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 RAP2CQ9Y3L5 183 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 EP400Q96L91 3159 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 SLC16A4O15374 487 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 EFCAB14O75071 495 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 PRAMEF1O95521 474 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 C9P02748 559 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 FCER2P06734 321 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 C8BP07358 591 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 MYL12AP19105 171 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 WDR49Q8IV35 697 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 FIBCD1Q8N539 461 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 PACRGLQ8N7B6 248 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 MED15Q96RN5 788 aa10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.65□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 56
KPNA3-201ENST00000261667 AKAP11Q9UKA4 1901 aa10.65□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 XPNPEP2O43895 674 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 IDH3AP50213 366 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF132P52740 706 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 GRB10Q13322 594 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 FAM205BPQ63HN1 556 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 LINC00523Q86TU6 105 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SLC47A2Q86VL8 602 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 BANPQ8N9N5 519 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 OR10T2Q8NGX3 314 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SLC39A13Q96H72 371 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ALPK1Q96QP1 1244 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 C12orf57Q99622 126 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 EGFL8Q99944 293 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SLC30A2Q9BRI3 323 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TTYH3Q9C0H2 523 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TIGARQ9NQ88 270 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 C2orf81A6NN90 581 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SUPT3HB4E1H0 165 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 MID1O15344 667 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 METTL18O95568 372 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CD53P19397 219 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TPMTP51580 245 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 POU4F3Q15319 338 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TEAD4Q15561 434 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 C16orf86Q6ZW13 317 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM126BQ8IUX1 230 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 THNSL1Q8IYQ7 743 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TRPV3Q8NET8 790 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 HDAC10Q969S8 669 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 REEP1Q9H902 201 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ACP6Q9NPH0 428 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 IFT46Q9NQC8 304 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 UFSP2Q9NUQ7 469 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TBC1D24Q9ULP9 559 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 A0A088AWK7 358 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 L7N2F9 121 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 OR5F1O95221 314 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ITGB3P05106 788 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PDGFRAP16234 1089 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 AOC1P19801 751 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 MPP1Q00013 466 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CDKL1Q00532 357 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CAMK1Q14012 370 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CNTD1Q8N815 330 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 BSNDQ8WZ55 320 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PEX13Q92968 403 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms