RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 MAGEB16A2A368 324 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 AP3B1O00203 1094 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 FCHO1O14526 889 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 GJB3O75712 270 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 CALB2P22676 271 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 CTHP32929 405 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 RGRP47804 291 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 RNF135Q8IUD6 432 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 UBP1Q9NZI7 540 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 PSMD3O43242 534 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 PLIN3O60664 434 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 APODP05090 189 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 SRFP11831 508 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 GRIA2P42262 883 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 RHOAP61586 193 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 DSC2Q02487 901 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ACCSLQ4AC99 568 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 FAM13CQ8NE31 585 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ISL2Q96A47 359 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 FCRL5Q96RD9 977 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 RBBP8Q99708 897 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 BTBD10Q9BSF8 475 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 EBF2Q9HAK2 575 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 LHX3Q9UBR4 397 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 L3MBTL1Q9Y468 752 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 TRIOO75962 3097 aa20■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 GSRP00390 522 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ASLP04424 464 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 TYK2P29597 1187 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 IRX4P78413 519 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 PFKPQ01813 784 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 PTPRNQ16849 979 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 DGKKQ5KSL6 1271 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 C16orf46Q6P387 395 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 SEMA3CQ99985 751 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 MGME1Q9BQP7 344 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 SIKE1Q9BRV8 207 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 IL22Q9GZX6 179 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 SLC25A51Q9H1U9 297 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ANTXRLA6NF34 631 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 TIMM44O43615 452 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 MAGEA12P43365 314 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 SERPINB8P50452 374 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 SCNN1BP51168 640 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 DLG2Q15700 870 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 WASHC2DQ5SRD0 308 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 STRA8Q7Z7C7 330 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ARRDC2Q8TBH0 407 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 MYO19Q96H55 970 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 TM6SF2Q9BZW4 377 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 TNKS2Q9H2K2 1166 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 PLA2G4CQ9UP65 541 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 VGLL3A8MV65 326 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 PROCP04070 461 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 NNMTP40261 264 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 CD86P42081 329 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 LIMK2P53671 638 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 AQP5P55064 265 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 CDH17Q12864 832 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 IHHQ14623 411 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 PCLAFQ15004 111 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 PON2Q15165 354 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 CERCAMQ5T4B2 595 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 NUDT18Q6ZVK8 323 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN8-208ENST00000635751 LINC00523Q86TU6 105 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms