RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC25Q86WR0 208 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 APCDD1Q8J025 514 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 CNTD1Q8N815 330 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 NAT16Q8N8M0 369 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 IPMKQ8NFU5 416 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 PPM1EQ8WY54 764 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 TADA1Q96BN2 335 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 SGSM3Q96HU1 749 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 SERPINB12Q96P63 405 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC3BQ96PB8 259 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 NOD2Q9HC29 1040 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 CASS4Q9NQ75 786 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 DUSP12Q9UNI6 340 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 VCANP13611 3396 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 ESYT3A0FGR9 886 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 SNAP91O60641 907 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 USP1O94782 785 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 ALDH1A2O94788 518 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 ETS1P14921 441 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF30P17039 623 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 CNTFP26441 200 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 OPRD1P41143 372 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 CHPFQ8IZ52 775 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 ARRDC2Q8TBH0 407 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD7Q92527 254 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 IL36AQ9UHA7 158 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 PKP3Q9Y446 797 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 H0Y858 1186 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 PSMD11O00231 422 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 TM4SF5O14894 197 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 CLGNO14967 610 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 SLC7A4O43246 635 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 TCEA3O75764 348 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 PGLSO95336 258 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 GHRHP01286 108 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 NUDT17P0C025 328 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 C5AR1P21730 350 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 ADRA1AP35348 466 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 NUDT1P36639 197 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 POLD2P49005 469 aa7.35□□□□□ -1.23
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