RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	TTC22	Q5TAA0	569 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	FAXC	Q5TGI0	409 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	RNF220	Q5VTB9	566 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF425	Q6IV72	752 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	MTFR2	Q6P444	385 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ARMCX2	Q7L311	632 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	GPR149	Q86SP6	731 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	GLRX5	Q86SX6	157 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	LONP2	Q86WA8	852 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	CEP112	Q8N8E3	955 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	BANP	Q8N9N5	519 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	TMIE	Q8NEW7	156 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	NEK11	Q8NG66	645 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	OR8K5	Q8NH50	307 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	HASPIN	Q8TF76	798 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ASB15	Q8WXK1	588 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ST8SIA4	Q92187	359 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	TANK	Q92844	425 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM162A	Q96A26	154 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM122A	Q96E09	287 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	MAGED4	Q96JG8	741 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	EGLN2	Q96KS0	407 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	OPALIN	Q96PE5	141 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	WAC	Q9BTA9	647 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	CALN1	Q9BXU9	219 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	NDST4	Q9H3R1	872 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	HIPK3	Q9H422	1215 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	SH2D4A	Q9H788	454 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM206	Q9H813	350 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	CABP5	Q9NP86	173 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	EURL	Q9NYK6	297 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	HACD3	Q9P035	362 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	C5AR2	Q9P296	337 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ASB1	Q9Y576	335 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	CACNG2	Q9Y698	323 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRM-204	ENST00000577468	ADCY9	O60503	1353 aa		3.09	□□□□□ -1.92

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