RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PQM1 296 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOBOXO60393 691 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAFKO60675 156 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCEA3O75764 348 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1QL1O75973 258 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 PEX11BO96011 259 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM228BP0C875 321 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT10P13645 584 aa7.18□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 KELP23276 732 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 AK4P27144 223 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 VIPR1P32241 457 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERPINB6P35237 376 aa7.18□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAZP56270 477 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TMPRSS3P57727 454 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 NR1I3Q14994 352 aa7.18□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 AMZ1Q400G9 498 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 BOLA3Q53S33 107 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC122Q5T0U0 273 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 PNCKQ6P2M8 343 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q6ZVL8 140 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM74Q86UV6 250 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCNJLQ8IV13 435 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 LSMEM2Q8N112 164 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 BBS5Q8N3I7 341 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 LZTR1Q8N653 840 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF599Q96NL3 588 aa7.18□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.268e-8■■■■□ 25.8
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 PISDQ9UG56 409 aa7.18□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 DGKBQ9Y6T7 804 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PQJ5 194 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.17□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SERPING1P05155 500 aa7.17□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PDHA1P08559 390 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITIH1P19827 911 aa7.17□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 UGT1A5P35504 534 aa7.17□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZBED6P86452 979 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 DSC2Q02487 901 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 FIGNQ5HY92 759 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHF19Q5T6S3 580 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.17□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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