RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	ODF2	Q5BJF6	829 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PERM1	Q5SV97	790 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZVL8	140 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ARL10	Q8N8L6	244 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR48	Q8TAF3	677 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DTD2	Q96FN9	168 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TEX101	Q9BY14	249 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	FGF22	Q9HCT0	170 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	INTU	Q9ULD6	942 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0J9YYE9	177 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	PRSS38	A1L453	326 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRD1	A4D1F6	860 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF487	B1APH4	448 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	ZZEF1	O43149	2961 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	TCEA3	O75764	348 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	JCHAIN	P01591	159 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBC1	P01850	177 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	MPO	P05164	745 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	CA4	P22748	312 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	LHCGR	P22888	699 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC1A1	P43005	524 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	LSS	P48449	732 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	GABRE	P78334	506 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	PTS	Q03393	145 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	DPT	Q07507	201 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC38	Q5VT99	294 aa		9.39	□□□□□ -0.91
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KIFC3-231	ENST00000567479	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	NLRP8	Q86W28	1048 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	PELI3	Q8N2H9	469 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	HDAC11	Q96DB2	347 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	PDXP	Q96GD0	296 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM5	Q9C035	493 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	DTL	Q9NZJ0	730 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	CHKB	Q9Y259	395 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	KNTC1	P50748	2209 aa		9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0U1RQS6	177 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNK1	O00180	336 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	APOL1	O14791	398 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	HLA-DQB2	P05538	268 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	CEACAM5	P06731	702 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	TNNT1	P13805	278 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	GLB1	P16278	677 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF30	P17039	623 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	TEAD1	P28347	426 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGEA1	P43355	309 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	ABCG1	P45844	678 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR1	P46091	355 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	CCL7	P80098	99 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	CDK3	Q00526	305 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	AP1B1	Q10567	949 aa		9.38	□□□□□ -0.91
KIFC3-231	ENST00000567479	SPIDR	Q14159	915 aa		9.38	□□□□□ -0.91

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