RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551206.5

USP15-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 1,022 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-217ENST00000551206 AMFRQ9UKV5 643 aa13.06□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 WASF3Q9UPY6 502 aa13.06□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 ANKRD36A6QL64 1941 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 A0A0J9YYE9 177 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 CCDC66A2RUB6 948 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 K7ESM1 405 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 TOR1BO14657 336 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 FTCDO95954 541 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 TRBC1P01850 177 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PYGMP11217 842 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PTPN3P26045 913 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 CTNNA2P26232 953 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PEX5P50542 639 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 RWDD2BP57060 319 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 NFATC4Q14934 902 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PCSK7Q16549 785 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 TEX44Q53QW1 395 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PRRT3Q5FWE3 981 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 LRRC66Q68CR7 880 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 AADACL2Q6P093 401 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PNCKQ6P2M8 343 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 CRTC1Q6UUV9 634 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 DHRS13Q6UX07 377 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 MACC1Q6ZN28 852 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 NT5DC3Q86UY8 548 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 MARCH9Q86YJ5 346 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PHACTR4Q8IZ21 702 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PELI3Q8N2H9 469 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 SPATA22Q8NHS9 363 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 NUS1Q96E22 293 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 HERPUD2Q9BSE4 406 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 OSBPL8Q9BZF1 889 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 SLC25A51Q9H1U9 297 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 C10orf88Q9H8K7 445 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 UBP1Q9NZI7 540 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 SPASTQ9UBP0 616 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 CD84Q9UIB8 345 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PPIL1Q9Y3C6 166 aa13.05□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 F5H423 210 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 H7C0C1 242 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 AQP9O43315 295 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PMPCBO75439 489 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 GCATO75600 419 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 CLDN7O95471 211 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PTMAP06454 111 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 GIMD1P0DJR0 217 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 CKMT2P17540 419 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 CETN2P41208 172 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 ATP5OP48047 213 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 SRP54P61011 504 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 COPS2P61201 443 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 DAB2P98082 770 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PTSQ03393 145 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 WASHC5Q12768 1159 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 MTM1Q13496 603 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 GALNT3Q14435 633 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PPP2R5EQ16537 467 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 QPCTQ16769 361 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 ALG11Q2TAA5 492 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 DEFB133Q30KQ1 61 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 BBS12Q6ZW61 710 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PID1Q7Z2X4 250 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 SYCE1Q8N0S2 351 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 OR4C6Q8NH72 309 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 BTN2A2Q8WVV5 523 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 DTD2Q96FN9 168 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 TEKT5Q96M29 485 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 FAM118BQ9BPY3 351 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 LGR4Q9BXB1 951 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 ADGRE3Q9BY15 652 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 GLOD4Q9HC38 313 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 MOSPD1Q9UJG1 213 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 GUCA1BQ9UMX6 200 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 ADGRG1Q9Y653 693 aa13.04□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 FAM149AA5PLN7 773 aa13.03□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 TMEM202A6NGA9 273 aa13.03□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 ANKRD66B4E2M5 251 aa13.03□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 ALPPL2P10696 532 aa13.03□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 CTSEP14091 401 aa13.03□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 TSHRP16473 764 aa13.03□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 HK3P52790 923 aa13.03□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 RPL26P61254 145 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
USP15-217ENST00000551206 PROX2Q3B8N5 592 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms