RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 HEATR9A2RTY3 570 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TMEM221A6NGB7 291 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 OR51F1A6NGY5 319 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GOLGA8KD6RF30 607 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 M0R296 226 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TTC4O95801 387 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ADH1BP00325 375 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SHBGP04278 402 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PRSS56P0CW18 603 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PSMA3P25788 255 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 VIPR1P32241 457 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 DGKEP52429 567 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 STC1P52823 247 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ADPRHP54922 357 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PTSQ03393 145 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ACVR1Q04771 509 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 DMWDQ09019 674 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SLMAPQ14BN4 828 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 DPPA4Q7L190 304 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FAM124AQ86V42 546 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FRMD1Q8N878 549 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 OR4K2Q8NGD2 314 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ZNF446Q9NWS9 450 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CHD6Q8TD26 2715 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 K7ESF4 209 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 AP3B1O00203 1094 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 UGT1A9O60656 530 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 MMP20O60882 483 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 ATG13O75143 517 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 ERLIN1O75477 346 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 SASH3O75995 380 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 USP1O94782 785 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 DNTTP04053 509 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 ERVK-10P10266 1014 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 BPIP17213 487 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 AOC1P19801 751 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 ACSL1P33121 698 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 HMGCLP35914 325 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 LIG3P49916 1009 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 TPMTP51580 245 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 PPP2CBP62714 309 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 PPP2CAP67775 309 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 XIAPP98170 497 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 FGL2Q14314 439 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 SLC29A2Q14542 456 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 MAP9Q49MG5 647 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 LIPIQ6XZB0 460 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 Q6ZVL8 140 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 RASSF3Q86WH2 238 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 PALM2Q8IXS6 379 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 PELI3Q8N2H9 469 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 GPR26Q8NDV2 337 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-216ENST00000549221 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.14□□□□□ -1.11
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