RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 CDK16Q00536 496 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 IL5RAQ01344 420 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 NFATC2Q13469 925 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ARSHQ5FYA8 562 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 OR4K2Q8NGD2 314 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 BCL2L14Q9BZR8 327 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 NMUR1Q9HB89 426 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 MYBPHLA2RUH7 354 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SLC28A2O43868 658 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 KCNA5P22460 613 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 IL12BP29460 328 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 HTR7P34969 479 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 TAS2R50P59544 299 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PLGLB1Q02325 96 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PRKG2Q13237 762 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CTBP1Q13363 440 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 AUHQ13825 339 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 DLG2Q15700 870 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 C16orf46Q6P387 395 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PPCDCQ96CD2 204 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 MAGEH1Q9H213 219 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 COG5Q9UP83 839 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 MRASO14807 208 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 TEX28O15482 410 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CAPN1P07384 714 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 DSC2Q02487 901 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 GKN2Q86XP6 184 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SEMA3GQ9NS98 782 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 GGA2Q9UJY4 613 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 FAM25AB3EWG3 89 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 FAM25CB3EWG5 89 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 FAM25GB3EWG6 89 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 C9J4A7 227 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 LRATO95237 230 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ECT2LQ008S8 904 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 EML3Q32P44 896 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM220Q6QAJ8 160 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 OR52K2Q8NGK3 314 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 KCTD4Q8WVF5 259 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 IRF7Q92985 503 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 THAP11Q96EK4 314 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 NEK6Q9HC98 313 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 EQTNQ9NQ60 294 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 HAO1Q9UJM8 370 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 NCANO14594 1321 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 A8MU76 341 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ITGAVP06756 1048 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 HOXB2P14652 356 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 FLT3P36888 993 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF132P52740 706 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PEX11AO75192 247 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 BANF1O75531 89 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ADRA1BP35368 520 aa9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms