RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 PRMT2P55345 433 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DSC2Q02487 901 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DSC1Q08554 894 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 IGSF11Q5DX21 431 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GRTP1Q5TC63 336 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 AADATQ8N5Z0 425 aa7.88□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 APBB2Q92870 758 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 NEURL2Q9BR09 285 aa7.88□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 WWP1Q9H0M0 922 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF358Q9NW07 568 aa7.88□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 KLHL3Q9UH77 587 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 VPS28Q9UK41 221 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PLLPQ9Y342 182 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ZW10O43264 779 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC6O75061 913 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 KRT6AP02538 564 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 KRT6BP04259 564 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RALBP11234 206 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 STMN1P16949 149 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RHOQP17081 205 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 WEE1P30291 646 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 EPHB3P54753 998 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ASPHQ12797 758 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 NFE2L1Q14494 772 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PHKG1Q16816 387 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PCID2Q5JVF3 399 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DDI1Q8WTU0 396 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SNX15Q9NRS6 342 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 OSER1Q9NX31 292 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PLK2Q9NYY3 685 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 USP3Q9Y6I4 520 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC37A2A6NM11 1700 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SLC38A8A6NNN8 435 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 LRG1P02750 347 aa7.87□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 COL6A1P12109 1028 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 HDCP19113 662 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PRKCHP24723 683 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PGGT1BP53609 377 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SP140Q13342 867 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TGFBIQ15582 683 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FAM26DQ5JW98 314 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DENND6AQ8IWF6 608 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CNTD1Q8N815 330 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FLCNQ8NFG4 579 aa7.87□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.87□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.87□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FANCEQ9HB96 536 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 NEK6Q9HC98 313 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MID2Q9UJV3 735 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ACOT9Q9Y305 439 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FAM159BA6NKW6 160 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ADAM12O43184 909 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CRCPO75575 148 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 C2P06681 752 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
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