RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	TLR10	Q9BXR5	811 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	SIK2	Q9H0K1	926 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	TNMD	Q9H2S6	317 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	INTS13	Q9NVM9	706 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	GCNT4	Q9P109	453 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	USP25	Q9UHP3	1055 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	SIX4	Q9UIU6	781 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PDE4D-222	ENST00000514552	LAMA5	O15230	3695 aa		7.15	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	AKAP13	Q12802	2813 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC78	A2IDD5	438 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF233	A6NK53	670 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	TACC1	O75410	805 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF202	O95125	648 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	EGF	P01133	1207 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	TNNC2	P02585	160 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	AHSG	P02765	367 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ARSA	P15289	507 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	MAK	P20794	623 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CYP2F1	P24903	491 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	MPL	P40238	635 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	STAT6	P42226	847 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	DPP6	P42658	865 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CASP5	P51878	434 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC7A9	P82251	487 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	PIGF	Q07326	219 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF844	Q08AG5	666 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	REST	Q13127	1097 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC39A14	Q15043	492 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	KBTBD6	Q86V97	674 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	HPDL	Q96IR7	371 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	SYT15	Q9BQS2	421 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	PANK4	Q9NVE7	773 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CDYL	Q9Y232	598 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	PTPRD	P23468	1912 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CAPN8	A6NHC0	703 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF785	A8K8V0	405 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	HRG	P04196	525 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	KRT19	P08727	400 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	IDE	P14735	1019 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	HDC	P19113	662 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	SYT1	P21579	422 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ANXA13	P27216	316 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	HOXD12	P35452	270 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	TUB	P50607	506 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	DGKE	P52429	567 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CXADR	P78310	365 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	DMC1	Q14565	340 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	GRM3	Q14832	879 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ST3GAL2	Q16842	350 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	STPG1	Q5TH74	334 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	PMS2CL	Q68D20	193 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PDE4D-222	ENST00000514552	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		7.13	□□□□□ -1.27

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