RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 ALPIP09923 528 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TSHRP16473 764 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 SPINK2P20155 84 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ILKQ13418 452 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 PRRT3Q5FWE3 981 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 BBS12Q6ZW61 710 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 CNTD1Q8N815 330 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 HAUS1Q96CS2 278 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TBATAQ96M53 351 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 VAT1Q99536 393 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR26Q9H7D7 661 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD66B4E2M5 251 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 H7C0C1 242 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP6O43182 974 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 KRT86O43790 486 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 RFPL3O75679 317 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 APOC2P02655 101 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ANXA6P08133 673 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ETV3P41162 512 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP5OP48047 213 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 SRP54P61011 504 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 SKOR1P84550 965 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC3Q13217 504 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 XRCC4Q13426 336 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ELOCQ15369 112 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TPRG1LQ5T0D9 272 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC66Q68CR7 880 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 CRTC1Q6UUV9 634 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 PLA2G15Q8NCC3 412 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 DTD2Q96FN9 168 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TEKT5Q96M29 485 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.973e-7■■■■□ 24.3
SH3BP2-210ENST00000505941 OSBPL8Q9BZF1 889 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 USP29Q9HBJ7 922 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 GLOD4Q9HC38 313 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 MSRB2Q9Y3D2 182 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRK1Q38SD2 2015 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 CAPN8A6NHC0 703 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 K7ESM1 405 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM38O00635 465 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TPP1O14773 563 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 PYGLP06737 847 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM23P36406 574 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 HK3P52790 923 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1024LP59773 190 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 RAET1GQ6H3X3 334 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 Q6ZVL8 140 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 PID1Q7Z2X4 250 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TSPAN33Q86UF1 283 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 OR56A4Q8NGH8 313 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 KLF15Q9UIH9 416 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 STK10O94804 968 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 MMP2P08253 660 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 LHCGRP22888 699 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPN3P26045 913 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPN7P35236 360 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR1P46091 355 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 RPIAP49247 311 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 E2F1Q01094 437 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 ADCY2Q08462 1091 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 C1orf61Q13536 156 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC14A2Q15849 920 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 PCSK7Q16549 785 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 PROX2Q3B8N5 592 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 KDELC2Q7Z4H8 507 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 GKN2Q86XP6 184 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 NRSN1Q8IZ57 195 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 RBFAQ8N0V3 343 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM181AQ8N9Y4 354 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-210ENST00000505941 AP2M1Q96CW1 435 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms