RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 HMX3A6NHT5 357 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 H0YC42 278 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIGNO95427 931 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 C7P10643 843 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITGB6P18564 788 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSMC5P62195 406 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD83Q01151 205 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 TEKQ02763 1124 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAPQ12884 760 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSMD5Q16401 504 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 GK5Q6ZS86 529 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 MCFD2Q8NI22 146 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 GAD1Q99259 594 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 AUP1Q9Y679 476 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A0U1RQS6 177 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 E2F8A0AVK6 867 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 HEATR9A2RTY3 570 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB5O15062 677 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFNA14P01570 189 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHRNA1P02708 482 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF30P17039 623 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL1R2P27930 398 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 OXTRP30559 389 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 HSD17B2P37059 387 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCR10P46092 362 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 BTN1A1Q13410 526 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPAT3Q53EU6 434 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 MICU2Q8IYU8 434 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC7A6Q92536 515 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF358Q9NW07 568 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 TLK1Q9UKI8 766 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D3-210ENST00000490478 LINC00862A6NCI5 91 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LINC00587B1AMM8 73 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SELLP14151 372 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRKCHP24723 683 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GCLMP48507 274 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRIM2P49643 509 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 BCAMP50895 628 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DYNLT1P63172 113 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPIL2Q13356 520 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNJ11Q14654 390 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RIT1Q92963 219 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNTNAP1P78357 1384 aa6.9□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L3A6NCW0 530 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L4A6NCW7 530 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR6C70A6NIJ9 312 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF487B1APH4 448 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCP10L2B9ZVM9 353 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYN3O14994 580 aa6.89□□□□□ -1.31
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