RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	GSR	P00390	522 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	KRT7	P08729	469 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ACVRL1	P37023	503 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	SULT1E1	P49888	294 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	MLLT10	P55197	1068 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	OR1D5	P58170	312 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	B4GALNT1	Q00973	533 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	KLRB1	Q12918	225 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	INPP5A	Q14642	412 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	GSE1	Q14687	1217 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	SLC18A3	Q16572	532 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	MYLK3	Q32MK0	819 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ART4	Q93070	314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	VOPP1	Q96AW1	172 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	NPY6R	Q99463	290 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	PCCB	P05166	539 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	KRT3	P12035	628 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ALDH4A1	P30038	563 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	DEUP1	Q05D60	604 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CDC20	Q12834	499 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ARTN	Q5T4W7	220 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ARC	Q7LC44	396 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	C3orf20	Q8ND61	904 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	MYBL1	P10243	752 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TIMP2	P16035	220 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	NR1D1	P20393	614 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	FECH	P22830	423 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	FHL5	Q5TD97	284 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TRIM11	Q96F44	468 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TBCB	Q99426	244 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	PARVA	Q9NVD7	372 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	RRN3	Q9NYV6	651 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344		A1L4Q6	167 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	FLT3	P36888	993 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	GSDMD	P57764	484 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SEPT6	Q14141	434 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	EMC1	Q8N766	993 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TEX19	Q8NA77	164 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF653	Q96CK0	615 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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