RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRAME-212ENST00000485532 TTC9Q92623 222 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-212ENST00000485532 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
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PRAME-212ENST00000485532 SMIM14Q96QK8 99 aa12.65□□□□□ -0.38
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