RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480623.6

EFHC1-202, Transcript of EF-hand domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene EFHC1, Length 2,549 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1-202ENST00000480623 SLC1A6P48664 564 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-202ENST00000480623 BIRC2Q13490 618 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-202ENST00000480623 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-202ENST00000480623 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-202ENST00000480623 LEMD2Q8NC56 503 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-202ENST00000480623 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-202ENST00000480623 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-202ENST00000480623 XPR1Q9UBH6 696 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-202ENST00000480623 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-202ENST00000480623 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-202ENST00000480623 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-202ENST00000480623 G3V2L1 256 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 KLF11O14901 512 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 PGLSO95336 258 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 GSTA1P08263 222 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 MYL2P10916 166 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 FMO4P31512 558 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 MC4RP32245 332 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 CLCN5P51795 746 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 AP1S1P61966 158 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 POU4F1Q01851 419 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ACVR1Q04771 509 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 Q6ZVU0 165 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ERP27Q96DN0 273 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 CIPCQ9C0C6 399 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 DPP7Q9UHL4 492 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 CCDC166P0CW27 439 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 CRABP2P29373 138 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ARFIP2P53365 341 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 OCRLQ01968 901 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 SLC14A2Q15849 920 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ZNF366Q8N895 744 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 TTC8Q8TAM2 541 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 VWA7Q9Y334 891 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ZNF711Q9Y462 761 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 CCR10P46092 362 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 USP4Q13107 963 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 RNF43Q68DV7 783 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 RTL10Q7L3V2 364 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 LMLNQ96KR4 655 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 MTG2Q9H4K7 406 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 FAM50BQ9Y247 325 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 FZD6O60353 706 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 NDUFS3O75489 264 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 SERPINE1P05121 402 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ARRB2P32121 409 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 STC1P52823 247 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ECT2LQ008S8 904 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 SETDB1Q15047 1291 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 GEN1Q17RS7 908 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 TMEM215Q68D42 235 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 EXT2Q93063 718 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 EID2BQ96D98 161 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 SAMD11Q96NU1 681 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 THAP1Q9NVV9 213 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 PKP3Q9Y446 797 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 NEMP2A6NFY4 417 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 OR1I1O60431 355 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-202ENST00000480623 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms