RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477447.6

TARDBP-208, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-208	ENST00000477447	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	WNT16	Q9UBV4	365 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PNMA2	Q9UL42	364 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PSAT1	Q9Y617	370 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	VCY	O14598	125 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	NDUFS7	O75251	213 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	MLYCD	O95822	493 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	FTCD	O95954	541 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ACADM	P11310	421 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	FCGR1A	P12314	374 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	LAMP2	P13473	410 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PLA2G2A	P14555	144 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	MAOA	P21397	527 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SSTR2	P30874	369 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	STX2	P32856	288 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ZXDB	P98169	803 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	OLIG2	Q13516	323 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	WDR63	Q8IWG1	891 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	NGEF	Q8N5V2	710 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	RND1	Q92730	232 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	MARK4	Q96L34	752 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	OR1F2P	Q96R84	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	FIZ1	Q96SL8	496 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CSF3R	Q99062	836 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	KXD1	Q9BQD3	176 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ITPA	Q9BY32	194 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	MUC13	Q9H3R2	512 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	EVPL	Q92817	2033 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A0U1RQJ8	604 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	LIPT2	A6NK58	231 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SOCS6	O14544	535 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC25A12	O75746	678 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF12	P17014	697 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	TNFRSF8	P28908	595 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PDLIM4	P50479	330 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CLCN3	P51790	818 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	MYBPH	Q13203	477 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	MAMLD1	Q13495	774 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CTF1	Q16619	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	AMZ1	Q400G9	498 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CDON	Q4KMG0	1287 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF585B	Q52M93	769 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	WDR73	Q6P4I2	378 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	DPPA4	Q7L190	304 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PGBD5	Q8N414	524 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	C1orf74	Q96LT6	269 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	HARBI1	Q96MB7	349 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	TMEM68	Q96MH6	324 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87

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