RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TAC1P20366 129 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ARNTP27540 789 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CRABP2P29373 138 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PMLP29590 882 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SERPINA4P29622 427 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 HLA-FP30511 346 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FOXN2P32314 431 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NNMTP40261 264 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ABL2P42684 1182 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC1A2P43004 574 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GRIA4P48058 902 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CLCN5P51795 746 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ECT2LQ008S8 904 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 POU4F1Q01851 419 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ACVR1Q04771 509 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RAD51Q06609 339 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 POU4F2Q12837 409 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TRAF2Q12933 501 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GRM3Q14832 879 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PDGFRLQ15198 375 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 DHCR24Q15392 516 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 DBN1Q16643 649 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MYLK3Q32MK0 819 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FUT11Q495W5 492 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ACCSLQ4AC99 568 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CARD16Q5EG05 197 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ATG16L1Q676U5 607 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RAPH1Q70E73 1250 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GALNT7Q86SF2 657 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GPR149Q86SP6 731 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 AHI1Q8N157 1196 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC63Q8NA47 563 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 OR4L1Q8NH43 312 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SMARCD2Q92925 531 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ISL2Q96A47 359 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 E2F7Q96AV8 911 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TIFAQ96CG3 184 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 VPS39Q96JC1 886 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GPR22Q99680 433 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 OBP2AQ9NY56 170 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GGT7Q9UJ14 662 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ARL5AQ9Y689 179 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 COL6A3P12111 3177 aa6.65□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.65□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 NCOR1O75376 2440 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 A0A087X1B8 175 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 A0A096LPK6 155 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PQ67 120 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 WDR91A4D1P6 747 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 DLL1O00548 723 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 FZD6O60353 706 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 PGLSO95336 258 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 ASLP04424 464 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-211ENST00000415409 PRKCGP05129 697 aa6.64□□□□□ -1.35
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